Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms