Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Cnn1Q08091 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Cnn1Q08091 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Cnn1Q08091 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Cnn1Q08091 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Cnn1Q08091 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Cnn1Q08091 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Cnn1Q08091 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Cnn1Q08091 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Cnn1Q08091 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Cnn1Q08091 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Cnn1Q08091 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Cnn1Q08091 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Cnn1Q08091 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cnn1Q08091 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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