Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MestQ07646 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms