Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col6a1Q04857 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col6a1Q04857 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms