Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top1Q04750 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top1Q04750 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms