Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CkbQ04447 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CkbQ04447 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms