Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms