Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VcpQ01853 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VcpQ01853 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VcpQ01853 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms