Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gbp1Q01514 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms