Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja5Q01231 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms