Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SelpQ01102 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms