Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin2bQ01097 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms