Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PrcdQ00LT2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms