Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
VegfaQ00731 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VegfaQ00731 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms