Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms