Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms