Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cbx1P83917 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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