Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SgcdP82347 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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