Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx1P81068 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx1P81068 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms