Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irx3P81067 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms