Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Usp9xP70398 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Usp9xP70398 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Usp9xP70398 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Usp9xP70398 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Usp9xP70398 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Usp9xP70398 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Usp9xP70398 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Usp9xP70398 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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