Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad1P70340 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms