Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vamp7P70280 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms