Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfixP70257 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfixP70257 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfixP70257 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfixP70257 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfixP70257 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfixP70257 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfixP70257 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfixP70257 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfixP70257 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfixP70257 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfixP70257 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfixP70257 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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