Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb4bP68372 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb4bP68372 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms