Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tra2bP62996 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tra2bP62996 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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