Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnrpfP62307 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms