Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rps29P62274 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
Rps29P62274 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms