Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmc5P62196 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms