Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vbp1P61759 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms