Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

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Length 70 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sem1P60897 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Sem1P60897 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Sem1P60897 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sem1P60897 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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