Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms