Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm2P58774 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm2P58774 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms