Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms