Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SmoP56726 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SmoP56726 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SmoP56726 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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