Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms