Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
GferP56213 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GferP56213 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GferP56213 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GferP56213 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GferP56213 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GferP56213 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GferP56213 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GferP56213 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GferP56213 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GferP56213 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GferP56213 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GferP56213 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GferP56213 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GferP56213 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GferP56213 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GferP56213 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GferP56213 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GferP56213 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms