Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bp1P55194 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bp1P55194 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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