Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ephb4P54761 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ephb4P54761 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms