Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ephb3P54754 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ephb3P54754 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ephb3P54754 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ephb3P54754 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ephb3P54754 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ephb3P54754 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ephb3P54754 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ephb3P54754 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ephb3P54754 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ephb3P54754 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ephb3P54754 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ephb3P54754 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ephb3P54754 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ephb3P54754 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ephb3P54754 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ephb3P54754 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ephb3P54754 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ephb3P54754 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ephb3P54754 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ephb3P54754 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ephb3P54754 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ephb3P54754 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ephb3P54754 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ephb3P54754 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ephb3P54754 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ephb3P54754 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ephb3P54754 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ephb3P54754 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ephb3P54754 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ephb3P54754 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ephb3P54754 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ephb3P54754 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ephb3P54754 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ephb3P54754 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms