Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ube2e3P52483 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ube2e3P52483 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ube2e3P52483 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube2e3P52483 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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