Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec1P51908 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec1P51908 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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