Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SftpbP50405 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SftpbP50405 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SftpbP50405 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SftpbP50405 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SftpbP50405 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms