Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms