Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psen1P49769 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psen1P49769 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms