Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Edn3P48299 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Edn3P48299 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms