Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Epb41P48193 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Epb41P48193 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Epb41P48193 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb41P48193 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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