Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl13P47963 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl13P47963 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms