Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtgfrP43117 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtgfrP43117 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms