Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mmp9P41245 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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